热风干化与微波干化的能耗差异源于热量传递方式的不同，热风干化依靠热空气与污泥的对流换热传递热量，热量需从污泥表面逐步传导至内部，存在热量损耗大、传递效率低的问题，整体能耗相对较高。
微波干化则通过微波辐射使污泥分子产生高频振动，利用分子摩擦生热实现污泥内部的均匀加热，热量传递无需依赖介质传导，热损失小，能量利用率高，相较于热风干化，其能耗更低。
能耗差异还与污泥的干化程度相关，热风干化若要达到较低的含水率，需延长热空气与污泥的接触时间，能耗会明显增加；微波干化的加热效率不受污泥含水率变化的明显影响，在深度干化工况下，能耗优势更为明显。同时，热风干化的能耗还受环境温度、湿度影响，而微波干化受外界环境干扰较小，能耗稳定性更强。
